Impact des sous-types viraux sur la progression de l' infection

Le VIH présente une grande variabilité génétique due à la rapidité du cycle de réplication, au grand nombre d´erreurs de transcription du génome lors de ce cycle et aux multiples recombinaisons d´ARN lors de la synthèse d´ADN proviral. Cette variabilité génétique est illustrée par le grand nombre de types et de sous-types viraux retrouvés chez les patients infectés. L´impact de cette diversité génétique sur la progression de la maladie a été établi à l´occasion d´études principalement transversales, et se traduit par des différences structurales influençant la réplication virale et la pathogénicité du virus. Cependant, de nombreux facteurs tels que la durée de l´infection par le VIH ou le niveau de réplication virale, n´ont pas toujours été pris en compte, alors qu´ils peuvent biaiser l´estimation de l´association entre types, sous-types et pathogénie. Une étude longitudinale menée au sein de la cohorte Ougandaise du district de Rakai a permis de mieux analyser le lien entre progression de la maladie et sous-types viraux, grâce à l´analyse des cas incidents d´infection par le VIH au cours de la période de suivi.

De plus, charge virale et durée d´infection ont pu être prises en compte grâce au schéma prospectif de l´étude. Entre 1999 et 2004, 491 cas de séroconversion VIH ont été relevés et 350 ont pu être analysés. Le sous-type viral majoritaire était le D (59,1%), suivi des recombinaisons de sous-types A et D (21,1%) puis du sous-type A (15,1%), tandis qu´un seul patient était porteur du sous-type C. Au cours des 5 ans de suivi, 129 patients ont présenté une baisse des lymphocytes CD4 sous le seuil de 250/mm3, 74 sont décédés de causes non liées au VIH et 68 d´évènements sida. Le temps d´évolution jusqu´au stade sida était plus court chez les patients porteurs du sous-type D (6,5 ans), de souches multiples ou de souches recombinantes A-D. De même, le risque de présenter un événement sida ou de décéder du sida était plus élevé chez les patients porteurs d´un sous-type D, recombinant ou avec souches multiples, même après ajustement sur la charge virale ou la durée d´infection VIH. La progression de l´infection par le VIH semble donc bien être influencée par la variabilité génétique de ce dernier, ce qui pourrait avoir un impact en terme d´initiation de traitement antirétroviral et de stratégie vaccinale visant à ralentir l´évolution de la maladie.

Kiwanuka N, Laeyendecker O, Robb M, Kigozi G, Arroyo M, McCutchan F, Eller LA, Makumbi F, Birx D, Wabwire-Mangen F, Serwadda D, Sewankambo NK, Quinn TC, Wawer M, Gray R. J Infect Dis 2008, 197: 707-13.